<國浣熊市核爆與永凍港危機後，全球對生化威脅的恐懼達到頂點。然而，保護傘公司與赤瞳公司的殘余勢力並未偃旗息鼓，他們在中東沙漠深處秘密重啟了代號“沙暴”的計劃——將t病毒與當地致命沙 基因融合，培育出能在高溫干旱環境中快速傳播的“沙蝕病毒”。這種病毒感染者會蛻變為渾身覆蓋堅硬甲殼的“沙蟲人”，不僅能鑽入沙地發動突襲，還能通過噴吐腐蝕性沙塵擴大感染範圍。
林悅帶領的反抗組織收到情報時，中東某石油城邦已淪為沙蝕病毒的重災區。整座城市被黃沙掩埋，街道上蠕動著半人半蟲的怪物，而地下的石油管道網絡則成了病毒擴散的天然通道。更可怕的是，保護傘公司在城市中心的煉油廠建造了巨型“病毒蒸餾塔”，將感染者的血肉提煉成氣溶膠，準備借助季風將病毒擴散到整個大陸。
潛入城邦的過程中，小隊遭遇了赤瞳公司研發的新型生化兵器“烈日機甲”。這些裝備著高溫射線炮的戰斗機器人，能將沙漠中的沙子瞬間熔化為滾燙的玻璃，所過之處寸草不生。在與機甲的交鋒中，陳岩為保護眾人，被射線灼傷腿部，行動嚴重受限。而小雨則在一座廢棄實驗室發現了驚人真相︰沙蝕病毒的研發，竟是為了制造能“進化”特定人種的基因武器。
當小隊逼近煉油廠時，塔內突然噴出遮天蔽日的黃沙毒霧。林悅的變異能力在高溫環境下受到壓制，卻意外覺醒了“熱能共鳴”——她能感知到方圓百米內所有熱源的分布。利用這一能力，眾人成功避開沙蟲人的伏擊，找到蒸餾塔的能量核心。但此時，保護傘公司派出的“死亡中隊”乘坐武裝直升機空降，他們不僅裝備了反變異體武器，還攜帶了能將沙蝕病毒逆向強化的“黑沙藥劑”。
生死關頭，小雨破譯了周薇遺留的加密文件，發現沙蝕病毒對低頻聲波極為敏感。陳岩冒險啟動煉油廠的巨型聲波裝置，劇烈的震動讓沙蟲人痛苦嘶吼，外殼紛紛龜裂。林悅則趁機沖向蒸餾塔頂端，在能量核心過載前的最後一刻，將自身變異能力與聲波共振，引發了一場足以摧毀整座建築的能量風暴。
爆炸的火光中，林悅等人駕駛著改裝越野車逃離城邦。然而，衛星圖像顯示，在他們身後，整片沙漠正在泛起詭異的紫色光澤——那是沙蝕病毒變異的前兆。更令人不安的是，反抗組織截獲的暗網通訊顯示，保護傘公司已將“沙暴計劃”的核心數據賣給了神秘的跨國集團。林悅握緊方向盤，目光望向遠方︰“下一個戰場，我們必須主動出擊。”
沙漠城邦的硝煙尚未散盡，反抗組織的情報網絡便捕捉到異常信號——太平洋某處神秘島嶼頻繁出現保護傘公司的運輸潛艇，衛星圖像顯示島上矗立著巨型球形建築，其表面布滿類似鰓裂的結構，在潮汐漲落間吞吐著幽藍的液體。林悅意識到，這可能是敵人為沙蝕病毒研發的“海洋版”變異載體。
當小隊乘坐改裝潛艇潛入島嶼時，深海的水壓與未知危險雙重壓迫著眾人神經。海底斷崖處，數十具浸泡在黏液中的尸體突然睜開渾濁的眼楮——這些被稱作“溺亡者”的變異體，皮膚已退化成半透明的薄膜，手指間生長出鋒利的蹼刃，能在水中以驚人的速度穿梭。陳岩腿部的舊傷在高壓下隱隱作痛，卻仍精準射擊，用特制的電擊魚叉暫時擊退了怪物群。
島嶼內部的景象顛覆了所有人的認知。巨大的生物反應器中，數以萬計的水母狀囊泡漂浮在淡紫色培養液里，每個囊泡都包裹著人類胚胎——這些正是融合沙蝕病毒與海洋生物基因的“海淵計劃”產物。更令人膽寒的是，保護傘公司與赤瞳公司的殘余勢力已與神秘的“深海議會”達成合作，這個由極端環保主義者組成的組織，妄圖用病毒清洗人類，將地球歸還海洋。
在通往核心控制室的通道中，小隊遭遇了名為“利維坦幼體”的巨型變異生物。它形似章魚與鯨魚的結合體，觸須布滿吸盤狀的腐蝕器官，張開的巨口能吞下整輛越野車。林悅在戰斗中被黏液腐蝕了戰甲，關鍵時刻，她的變異能力再次進化——通過接觸海水，她能短暫操控水流形成屏障，甚至凝聚出尖銳的水刃反擊。
當眾人終于抵達控制中樞，卻發現啟動病毒發射的密鑰竟是小雨的生物特征。深海議會的首領現身，此人戴著瓖嵌珍珠的面具，聲音冰冷︰“威廉•柏金的血脈，將成為人類進化的鑰匙。”原來，周薇當年叛逃赤瞳公司，正是為了執行這項“海洋復興”計劃，而小雨攜帶的特殊基因，能激活所有病毒胚胎。
倒計時開始後，島嶼底部的推進器緩緩啟動——整座島嶼竟是一艘巨型生化航母，即將駛向人口密集的海岸線。林悅與陳岩分頭行動，一個破壞能源核心，一個保護小雨。在最後的混戰中，小雨強忍恐懼，主動接入系統，利用周薇留下的後門程序篡改了病毒指令。然而，這一舉動激怒了深海議會首領，他注射強化藥劑，變異成半人半魚的怪物，利爪直取小雨咽喉。
千鈞一發之際，林悅爆發全部力量，將海水壓縮成透明的能量光束貫穿怪物軀體。島嶼在劇烈的爆炸中沉入海底，但在撤離時，陳岩為掩護眾人，被坍塌的金屬梁柱壓住。他將逃生艙強行關閉，對林悅嘶吼︰“活下去！找到病毒的源頭！” 潛艇浮出水面的瞬間，身後的海面騰起巨大的蘑菇雲，而林悅攥著陳岩遺留的警徽，眼中燃燒著復仇的火焰——深海議會的陰謀，以及保護傘公司的終極秘密，她發誓要全部終結。
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