在經過一番周折後，佐助一行人終于抵達了北秘所。這里是一個神秘而危險的地方，隱藏著釋放咒印力量的源頭——重吾。重吾是一個具有特殊能力的人，他體內的咒印力量非常強大，但同時也給他帶來了雙重性格的困擾。
平時，重吾的性格溫和，與人相處融洽，但當咒印爆發時，他就會失去理智，被殺人的沖動所控制。這種狀態下的重吾極其危險，任何人都可能成為他的攻擊目標。
佐助深知重吾的危險性，但他並沒有退縮。相反，他決定利用自己的實力來震懾住處于咒印狀態的重吾。當佐助展現出強大的實力時，重吾被他的氣勢所壓制，逐漸恢復了理智。
重吾對于佐助的實力感到驚訝，同時也對他產生了濃厚的興趣。作為君麻呂生前的好友，重吾一直想知道君麻呂不惜犧牲生命抓來的佐助究竟是個什麼樣的人。經過一番交流，重吾決定加入佐助的隊伍，一起去實現他們的目標。
就這樣，佐助的四人小隊正式組成。他們給這個小隊取名為“蛇”，寓意著他們像蛇一樣狡猾、靈活，並且充滿著致命的威脅。他們的目標只有一個，那就是殺死鼬，為君麻呂報仇。
隨著“蛇”的出現，整個世界都將因為他們的行動而發生巨大的變化。木葉村得知了大蛇丸被佐助所殺的消息後，立刻展開了對佐助的搜索行動。他們不能讓佐助這樣的危險人物在外面游蕩，必須將他找回或者消滅。
而此時的佐助，正在尋找鼬的路上。然而，他的旅程並不順利，途中遭遇了“曉”的成員迪達拉和一個神秘的“面具男”。這場遭遇戰將會給佐助帶來怎樣的挑戰呢？
迪達拉曾經與宇智波鼬交過手，結果以失敗告終。不僅如此，佐助還殺死了本該由他親手解決的大蛇丸，這讓迪達拉對佐助心生不滿，于是他主動向佐助發起挑戰。
在激烈的戰斗中，兩人都使出了渾身解數，互不相讓。經過一番苦戰，雙方都身受重傷，迪達拉眼見無法戰勝佐助，便心生一計，想要與佐助同歸于盡。
然而，佐助擁有寫輪眼這一強大的能力，他在關鍵時刻用寫輪眼控制萬蛇，成功地躲避了迪達拉的自爆攻擊，從而幸免于難。
之後，“蛇”來到了“曉”的根據地，佐助在這里再次與鼬相遇。鼬見到佐助後，並沒有立刻動手，而是指示佐助前往宇智波一族的故地，去那里做個了斷。
佐助听從了鼬的指示，來到了宇智波一族的故地。在這里，他與鼬展開了一場驚心動魄的對決。兩人一邊交談，一邊進行著激烈的戰斗。
在戰斗過程中，佐助從鼬的口中得知了一個驚人的消息︰宇智波一族的原首領、木葉村的創立者之一——斑竟然還活著！而且，斑與鼬聯手滅掉了整個宇智波一族。
更讓人震驚的是，斑是宇智波一族中第一個開啟萬花筒寫輪眼的人，他還曾以這雙眼楮馴服了九尾。這個消息對于佐助來說，無疑是一個巨大的沖擊。
佐助之前就已經閱讀過關于一族的石碑，知曉了萬花筒寫輪眼最終會失明這一殘酷的事實。然而，就在他與鼬的決戰前夕，鼬卻向他透露了一個驚人的秘密——原本就是萬花筒寫輪眼擁有者的人，可以從自己兄弟那里奪取同樣的眼楮，從而創造出一種帶有獨特力量的新眼楮，被稱為“永恆萬花筒寫輪眼”。
佐助震驚地听著鼬的講述，這才恍然大悟，原來鼬當年故意留下他的性命，就是為了讓他成為自己獲取永恆萬花筒寫輪眼的關鍵。在明白了這一切之後，佐助毫不猶豫地與鼬展開了一場驚心動魄的生死較量。
兩兄弟你來我往，不斷使出各自的絕招，互不相讓。佐助的實力已經有了質的飛躍，他在與鼬的交鋒中，展現出了驚人的成長和進步。他先後破解了鼬最強的精神攻擊“月讀”以及最強的物理攻擊“天照”，但這也讓他耗費了大量的查克拉。
盡管如此，佐助並沒有絲毫退縮之意。他深知這場戰斗的重要性，決定用自己精心準備的最強技能來一決勝負。就在這時，人們才發現，佐助之前使用的豪龍火之術射向天空並非是為了攻擊鼬，而是另有深意。
原來，佐助的目的是通過豪龍火之術制造出積雨雲，進而引發雷電。他巧妙地利用了自然界巨大的雷電之力，將其通過手中的雷電引導向鼬。這一招可謂是出其不意，讓鼬完全措手不及。
這一招“麒麟”威力極其巨大，猶如九天神雷一般，帶著毀天滅地之勢狠狠地砸向了整個據點。剎那間，地動山搖，煙塵彌漫，整個據點在這恐怖的力量面前瞬間土崩瓦解，化為一片廢墟。
佐助看著眼前的景象，心中不禁涌起一陣狂喜。他原本以為這一擊已經將鼬置于死地，然而，就在他準備上前確認鼬的生死時，令人意想不到的事情發生了。
就在麒麟劈下的瞬間，鼬竟然在千鈞一發之際開啟了須佐能乎！那巨大的紫色骨架如同一座堅不可摧的堡壘，硬生生地抵擋住了佐助的攻擊。
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就在佐助驚愕之際，原本被他奪去力量、吸收在體內的大蛇丸，卻在此時突然發難。趁著佐助力量耗盡的時機，大蛇丸妄圖一舉佔據佐助的身體，于是使出了自己最為強大的術——“八歧之術”。
只見大蛇丸的身體瞬間膨脹起來，化作一條巨大的八歧大蛇。這條大蛇身軀龐大，八個頭顱猙獰可怖，口中噴出熊熊烈焰，仿佛要將整個世界都吞噬殆盡。
然而，面對如此恐怖的敵人，鼬卻毫無懼色。他操控著須佐能乎，如戰神一般與八歧大蛇展開了一場驚心動魄的對決。
須佐之男手中的巨劍閃爍著寒光，每一次揮舞都帶起一陣狂風，與八歧大蛇的攻擊激烈踫撞。一時間，火花四濺，震耳欲聾的巨響回蕩在這片廢墟之上。
經過一番鏖戰，八歧大蛇的八個頭顱終于被須佐之男先後斬下，失去頭顱的大蛇身體也隨之癱倒在地。而大蛇丸本人，則被須佐能乎的“十拳劍”刺中，瞬間被封印在一個葫蘆里。
隨著大蛇丸被封印，佐助身上的天之咒印也如同失去了支撐一般，漸漸消散。至此，佐助終于擺脫了大蛇丸的控制，恢復了自由。
然而，此時的佐助和鼬都已經到了極限。佐助的身體因為過度使用力量而變得極度虛弱，連寫輪眼都無法再開啟。而鼬的雙眼也因為長時間使用須佐能乎而瀕臨失明，嘴角不斷溢出鮮血，他的須佐能乎也在搖搖欲墜，似乎隨時都可能消散。
面對鼬強大的“須佐能乎”，佐助毫無還手之力，他只能不斷地用草 劍和引爆符發起攻擊，但這些攻擊都如同蚍蜉撼樹一般，被鼬的須佐能乎輕松擋下。
鼬的須佐能乎手持“八咫鏡”，這面鏡子能夠反彈一切物理攻擊，佐助的攻擊在它面前就如同孩童的戲耍一般，根本無法對鼬造成任何實質性的傷害。
隨著鼬的步步逼近，佐助只能不斷地後退，他的心中充滿了絕望和無助。然而，就在佐助以為自己必死無疑的時候，鼬卻突然停了下來。
鼬面帶微笑，緩緩地走到佐助面前，然後輕輕地在佐助的額頭前點了一下，說道︰“原諒我，佐助，這是最後一次了。”
說完這句話，鼬的身體像是失去了支撐一般，轟然倒下。天空漸漸暗了下來，陣雨蒙蒙，仿佛整個世界都在為鼬的離去而哭泣。
而那團天照之火，卻依舊在熊熊燃燒著，仿佛永遠不會熄滅。
佐助呆呆地看著倒在地上的鼬，他的心中充滿了復雜的情感。當他確認鼬已經徹底失去了生命跡象之後，他淒涼地笑了一下，然後也緩緩地倒在了鼬的身旁。
兄弟二人就這樣並列躺在地上，他們之間的距離是如此之近，卻又仿佛永遠隔絕。
就在這時，一個戴著面具的神秘人出現在了現場。他默默地走到佐助身邊，將已經昏迷的佐助抱了起來。
“面具男”看著佐助，輕聲說道︰“我是斑，宇智波斑。”接著，他向佐助講述了宇智波一族與木葉之間的恩怨，以及鼬的真實身份和滅族的真相。
佐助得知真相後開始慢慢回憶起鼬的過往，漸漸相信了“面具男”所說的一切，憤怒與悲傷使得他開啟了萬花筒寫輪眼。
他將“蛇”改名為“鷹”，並決定殺掉逼迫鼬的幕後黑手——志村團藏等三位木葉高層，以及摧毀對宇智波一族實行滅族政策的木葉。
捕捉八尾佐助率領的“鷹”與“面具男”所率的“曉”暫時聯手，作為條件，“鷹”為“曉”捕捉身處雷之國的八尾人柱力奇拉比。
在雲雷峽上，佐助與八尾人柱力•奇拉比交戰。由于咒印力量的消失，又是剛開眼的首次作戰，導致剛開始有些吃力，連續兩次被其擊倒，後“鷹”合力將奇拉比壓制。
奇拉比是忍者歷史上少有的能完美控制尾獸之力的人，他完全尾獸化並對“鷹”步步緊逼。佐助眼見身邊的隊友們為了自己不惜生命，想起了以前的第七班，遂使用萬花筒寫輪眼釋放了——“天照”。
熊熊的黑色火焰在八尾身上劇烈地燃燒著，仿佛要將它整個吞噬。八尾在痛苦的掙扎中，突然將帶有黑火的一條尾巴猛地揮向香磷。佐助見狀，毫不猶豫地施展出千鳥銳槍，瞬間割斷了那部分尾巴。
然而，盡管尾巴被割斷，斷尾依然如同流星一般疾馳而去，狠狠地擊中了香磷的背部。剎那間，黑炎如惡魔般在香磷身上蔓延開來，她的身體被熊熊的黑火所籠罩。
佐助心急如焚，他絕不能讓同伴受到傷害。在這千鈞一發之際，他迅速沖上前去，用盡全身的力量將香磷身上的黑火撲滅。與此同時，八尾身上的火焰也因為佐助的這一舉動而逐漸熄滅。
“鷹”小隊的成員們眼見形勢不妙，急忙撤退。然而，他們沒有察覺到，八尾早已趁著佐助為了救香磷而割斷尾巴的瞬間，成功地利用斷尾逃脫了束縛。
這場驚心動魄的戰斗，不僅讓“鷹”小隊的計劃落空，更驚動了八尾的主人——奇拉比的哥哥，第四代雷影。而此時的“鷹”小隊，在經過一番休整後，做出了一個驚人的決定︰向木葉村發起進攻！
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然而，就在他們前往木葉的途中，一個神秘的面具男突然出現，告知他們木葉村已經被摧毀。這個突如其來的消息讓“鷹”小隊的成員們驚愕不已。
面對這一變故，“鷹”小隊迅速改變了目標，決定潛入正在舉行的五影大會，企圖刺殺代理火影的志村團藏！
“鷹”小隊在絕的帶領下，一路前行，終于抵達了五影大會的會場。然而，他們萬萬沒有想到，絕竟然在這個關鍵時刻背叛了他們。絕將佐助潛入的消息透露給了五影，這讓原本就緊張的局勢瞬間變得劍拔弩張。
得知佐助的到來，雷影怒不可遏，他立刻下令展開搜索，誓要將佐助找出來。沒過多久，雷影就發現了佐助的蹤跡，並毫不猶豫地沖向他，一場驚心動魄的戰斗就此爆發。
第四代雷影•艾，以其強大的實力而聞名。他的速度快如閃電，力量更是驚人。面對如此強敵，佐助毫不畏懼，他使出了自己的絕技——千鳥和天照。一時間，電光火石交織，火焰熊熊燃燒，場面異常激烈。
在激烈的戰斗中，佐助竟然首次開啟了須佐能乎，這一強大的忍術讓他的實力大增。然而，雷影的實力也同樣不容小覷，他的攻擊猶如雷霆萬鈞，讓人難以抵擋。雙方你來我往，互不相讓，戰斗陷入了膠著狀態。
為了戰勝雷影，佐助使出了炎遁•加具土命，這是一種極其強大的火遁忍術。然而，雷影並沒有被佐助的攻擊嚇倒，他選擇了玉石俱焚，寧可與佐助同歸于盡，也要堅持發動攻擊。
就在這千鈞一發之際，第五代風影•我愛羅突然出現。他迅速施展出砂之盾，將雷影和佐助的攻擊隔絕開來，避免了兩敗俱傷的局面。雷影見勢不妙，暫時退下，去治療他那斷掉的左手。
而佐助則不得不面對我愛羅以及其他四位影的圍攻。這場戰斗的勝負，似乎已經難以預料……
在激烈的戰斗中，佐助毅然決然地施展出了須佐能乎，那巨大而威猛的身影如同一座不可逾越的山岳，穩穩地矗立在戰場中央。它以無匹的威勢，硬生生地抵擋住了眾人的合力攻擊，發出震耳欲聾的巨響。
然而，佐助並沒有選擇與眾人繼續纏斗下去，他的目標只有一個——團藏。只見他身形一閃，如同鬼魅一般，瞬間突破了眾人的防線，如離弦之箭般直奔團藏所在的會談場所。
當佐助如疾風般沖入會場時，他的目光如炬，緊緊地鎖定了團藏。然而，就在他即將與團藏交鋒之際，一個身影如鬼魅般閃現，攔住了他的去路。
來人正是第五代水影•照美冥，她與“曉”有著深仇大恨，自然不會放過這個與“曉”成員交手的機會。照美冥的實力不容小覷，她不僅擁有溶遁、沸遁兩種血繼限界，更是一位經驗豐富的忍者。
佐助此時已經連續與多名高手交戰，體內的查克拉消耗巨大，再加上過度地使用須佐能乎，他的身體已經到了極限。每一個細胞都像是被撕裂一般，疼痛難忍，讓他難以集中精力應對照美冥的攻擊。
面對照美冥凌厲的攻勢，佐助漸漸有些力不從心。他的須佐能乎在水影強大的忍術面前，也顯得有些搖搖欲墜。
就在佐助陷入絕境之時，一道白色的身影如閃電般疾馳而來。原來是白絕及時趕到，為佐助解了圍。
白絕的出現讓佐助稍稍松了一口氣，但他的身體已經疲憊到了極點，幾乎無法再支撐下去。就在他以為自己終于可以喘口氣的時候，一個更加可怕的敵人悄然現身。
第三代土影•大野木，這位實力深不可測的老牌忍者，突然使出了他的獨門絕技——塵遁。那恐怖的力量如同一股洪流，瞬間將佐助淹沒。
“面具男”出現在逃離會場的團藏面前，在打敗了團藏的兩個護衛後，“面具男”從異空間里放出佐助與團藏對決。
佐助質問團藏關于鼬的真相，在團藏說出真相、稱鼬為木葉叛徒後徹底怒火爆發，用須佐能乎將團藏捏碎，但此時團藏卻又再次出現在佐助身後，兩人繼續對決。
佐助不斷使用天照、須佐能乎等招數“殺死”團藏，但團藏仍能不斷“復活”，而團藏更抓住機會使用咒印將佐助定住。
就在佐助即將被團藏殺死的千鈞一發之際，他的腦海中突然閃過了鼬的身影。這一瞬間，佐助的內心被一股強大的力量所觸動，他的須佐能乎竟然開始進化！原本只有骨骼的須佐能乎，此刻迅速長出了肌肉和皮膚，變得更加完整和強大。
佐助的須佐能乎如同脫胎換骨一般，輕易地沖破了團藏施加在他身上的咒印，瞬間扭轉了局勢。團藏見狀，心中大驚，他萬萬沒有想到佐助竟然能夠在如此絕境中突破自我。
而隨著戰斗的進行，團藏那種不死身能力的真面目也漸漸浮出水面。據“面具男”所說，那是一種連宇智波一族都將其列為禁術的“伊邪那岐”。這種禁術可以讓使用者在一定時間內免疫所有傷害，但同時也會對使用者的身體造成巨大的負擔。
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在接下來的攻防持久戰中，佐助充分發揮了自己的智慧和技巧。他巧妙地運用幻術，讓團藏產生了誤判，從而找到了團藏的破綻。最終，佐助以一記凌厲的攻擊，將團藏擊倒在地。
然而，瀕死狀態的團藏並不甘心就這樣落敗。他在最後關頭，竟然挾持了香磷做人質，企圖以此來威脅佐助。佐助此時已經被仇恨沖昏了頭腦，他毫不猶豫地使出了千鳥銳槍，直直地刺向團藏和香磷的要害。
香磷被這突如其來的變故驚呆了，她完全沒有想到佐助會如此決絕。而團藏則在千鳥銳槍的穿刺下，發出了一聲慘絕人寰的尖叫。
盡管團藏已經身受重傷，但他仍然不肯放棄。他用盡最後一絲力氣，發動了“里四象封印”，想要將“面具男”和佐助一同封印起來。然而，這最後的掙扎也未能成功，團藏最終還是咽下了最後一口氣。
佐助打敗團藏後，櫻、卡卡西、鳴人先後趕來，第七班重聚。佐助的千鳥與鳴人的螺旋丸再次對峙，雙方在精神世界里交談，兩人始終未能達成一致，但佐助答應了鳴人的決戰約定，後和“面具男”一起離開了現場。
由于頻繁使用萬花筒寫輪眼，佐助的視力嚴重下降，他決定听從“面具男”的建議，移植鼬的眼楮。
兄弟聯手佐助成功移植了鼬的眼楮，瞳力的融合讓雙眼升級為永恆萬花筒寫輪眼。他殺死了監視自己的白絕本體，準備出發上戰場。
途中佐助無意間看到被穢土轉生的鼬，隨即跟了上去。佐助了解到鼬的目的是前往阻止穢土轉生，他答應會告訴佐助想知道的一切，但必須先打敗藥師兜。兄弟二人在戰斗中互相配合，找回了塵封已久的默契。
最終，鼬以禁術“伊邪那美”將兜控制，並讓他說出解開穢土轉生的方法，從而解開了穢土轉生。
戰場上因兜操縱穢土大軍而混亂不堪的戰況得以控制，所有被轉生者開始靈魂升天。
鼬將自己知道的宇智波滅族事件所有內情，自己的想法都告訴了佐助，並承認自己因為不相信佐助的力量與意志，而導致佐助離開木葉等行為。
但這次，鼬選擇相信佐助，認為他也許能改變一族。最終鼬對佐助說︰“無論將來你選擇什麼樣的道路，我都一直深愛著你。”
鼬靈魂升天，佐助在與鼬交流後重新思考“一族是何物？村子是何物？忍者又是何物？”這時，水月和重吾帶著在大蛇丸據點無意間找到的秘密卷軸來找佐助。
佐助翻開卷軸，決定通過它解開心中疑惑。
佐助回憶過去卡卡西的封邪法印，反向結印使出解邪法印，通過御手洗紅豆身上的咒印復活了大蛇丸，然後帶著水月、重吾與大蛇丸一起出發尋找答案。
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