飛船在雙重威脅下劇烈震顫，蕭處楠看著舷窗外扭曲的人臉樹皮，突然發現那些眼楮里閃爍著與熵寂教團相似的幽紫色光芒。“混沌秩序核心” 開始發燙，核心表面浮現出細密的紋路，竟與古樹的年輪如出一轍。
“小心！樹根在纏繞飛船！” 艾莉絲尖叫著，魔法權杖射出金色光束試圖切斷樹根，卻被樹皮吸收轉化為攻擊。粗壯的樹根如同巨蟒般纏繞著飛船，金屬外殼發出不堪重負的呻吟。時間將破碎的時空腕表碎片嵌入控制台，勉強發動一次時空躍遷，飛船險之又險地避開致命絞殺，撞進古樹的一片枝椏中。
艙門剛打開，帶著腐臭氣息的藤蔓便席卷而來，藤蔓尖端生長著能吞噬能量的花苞。蕭處楠揮劍斬斷藤蔓，鹿關劍卻傳來刺骨寒意 —— 這些植物竟在逆向吸收生命之力。更糟的是，熵寂教團的士兵已通過傳送裝置登上古樹，他們手持的武器上纏繞著黑色鎖鏈，鎖鏈末端勾著散發詭異光芒的 “熵核”。
“分散突圍！” 蕭處楠將一塊逆熵密鑰碎片拋給艾莉絲，自己帶著另一塊沖向古樹主干。他的腳步突然頓住，樹皮上浮現出古老的壁畫︰曾經的生命古樹開滿璀璨花朵，樹下站著身披綠甲的守護者，而其中一人的面容，赫然與熵寂教團首領有七分相似！
“這是... 古樹的記憶？” 蕭處楠觸踫壁畫，整棵古樹突然劇烈搖晃。金色光芒從他懷中的碎片迸發，照亮了隱藏在年輪中的秘密通道。通道深處，第三塊逆熵密鑰碎片懸浮在一顆跳動的 “生命核心” 上方，而在核心旁邊，一個被藤蔓纏繞的身影緩緩抬頭 —— 竟是早已 “犧牲” 的引魂者！
“好久不見，守護者們。” 引魂者的聲音沙啞，他的身體半透明，隱約可見體內流動的黑色能量，“生命古樹的背叛者，從來不是它自己。” 他揮動手臂，困住眾人的藤蔓突然調轉矛頭，纏住了熵寂教團的士兵。原來，當年熵寂教團首領竊取了古樹的守護之力，將生命核心污染，讓古樹成為守護逆熵密鑰的 “牢籠”。
熵寂教團的母艦此時發動終極武器，一道能將物質分解成基本粒子的 “熵化射線” 射向古樹。蕭處楠、艾莉絲和時間將三塊碎片與 “混沌秩序核心” 融合，光芒中浮現出宇宙誕生時的創世之火。當光芒與射線相撞，整個空間開始回溯 —— 古樹恢復了生機，引魂者的身體也逐漸變得凝實。
然而，就在眾人以為危機解除時，熵寂教團首領的虛影出現在天空。他狂笑著︰“你們以為這就是結束？當三塊碎片合一，反而激活了熵滅之主的甦醒倒計時！” 說罷，虛影消散，宇宙各處開始出現黑色裂縫，從中傳出低沉的咆哮。引魂者臉色大變︰“我們必須立刻前往熵寂之主的封印之地，否則一切都將......” 他的話被突然爆發的能量風暴打斷，古樹在風暴中開始崩解，而在混亂中，有一雙眼楮始終盯著逆熵密鑰，準備伺機而動......