臨走前，小剛再次向喬伊小姐告白，也再次毫無意外地被發出魔性笑聲的蛙哥用毒擊干倒並拖走。
就這樣，尼比道館史上最大的危機被解決了。
而另一邊，與小光和小剛都分別了的小智，回到了真新鎮的家里。
在跟媽媽花子，還有大木博士，以及寄放在大木研究所後院里的寶可夢們打過招呼後，小智在家里待了幾天。
這次的神奧地區之旅大約過了7個月的時間，從自己穿越過來到現在，已經過了整整兩年零8個月左右了。
幾天後，大木博士來找小智和花子，說是他應邀要去合眾地區出席一個學術會議，要前往合眾地區。
而在會議之外的時間，都是空閑時間，所以想要邀請小智和花子一起去旅行。
花子和小智都表示願意。
花子是因為很久沒有一起出去旅行了，而小智則是身不由己，他本來是不太想去合眾地區的，
但是因為寶可夢檢察組織最近改革了，更名為寶可夢監察局，pokeon inspection agency，簡稱為pia。
仍然隸屬于寶可夢聯盟，小智不僅職位沒變，還升了一級。
並且組織上得知合眾地區當地的等離子團最近正在蠢蠢欲動，所以派遣小智前往合眾地區搗毀它。
小智當即接令。
合眾地區，是位置相較關都，城都，豐緣和神奧地區都非常遙遠的一個地區。
其海上有一個藍莓學園。
其名字，意為在合眾地區，雖然有多種多樣的寶可夢，多種多樣的人，但大家都作為生物共處同一種生態系。
與其設計原型的國家一樣。
合眾地區被河流分隔成中央區域，東方的半島與西方的陸地，河川本身則通往南方的海洋。
除了村莊橋周邊地方以外，由于橋梁較高，人們不能在河里沖浪。
天箭橋，帆巴吊橋，圓筒橋，奇幻橋和村莊橋五條橋梁分別從中央區域通向東西兩邊。
有兩個道館位于東南區域，對想要參賽聯盟的訓練家很重要。
東北區域則偏向休閑觀光。
中央區域包含了和眾兩座最大的城市飛雲市和雷文市，以及正北方的雙龍市，這三個城市都設有道館。
西方區域包含一些中型城市，這里能看到和其他區域不相同的風景。
西方區域也有三個道館，是寶可夢訓練家必須前往的地區。
合眾地區包括鄉村與城區，有十五個各有特色的聚落。
很多城市建有像現實世界的建築物，如三曜市和飛雲市。
而其它城市則更接近其他地區中的城市，例如合眾最大的都市飛雲市，紅豆杉博士居住的鹿子鎮等等。
雖然合眾地區的技術似乎比其他地區較先進，但是區域之間的發展並不平衡。
本來我很是不想寫合眾地區的，因為合眾地區的動畫質量在所有寶可夢動畫中是墊底的存在，直到旅途動畫出來之後，超級願望才榮升為倒數第二。
而且後面的卡洛斯地區實在是太亮眼了，但還是寫吧，我不喜歡不代表你們不喜歡，苦了我也不能苦了你們啊。
因為但是動畫制作的時候某八嘎國發生了地震，導致主線劇情被刪掉了很多，但是超級願望可以吐槽的東西實在是太多了，我給你們列舉部分。
第一，對戰。
超級願望的對戰寫的都是些什麼破玩意兒啊。
聯盟賽小智六打五輸給了虎徹，剛到合眾地區小智的滿級皮神輸給修帝的五級藤藤蛇，小智打霍米加六打三才勉強打贏……
你再對比珍鑽的對戰，無論是小智和真司之間的兩場全面對戰，還是鈴蘭大會上的精彩對戰，都吊打超級願望十條街。
第二，小智的寶可夢訓練不足，完全是寶寶隊。
在前面幾代，小智也有一些寶可夢是沒有完全進化就去打聯盟比賽的，比如原動畫中的小鋸鱷，火岩鼠，龍蝦小兵，月桂葉，杰尼龜，妙蛙種子等等，
但是每一代也就一兩只，兩三只，
到了超級願望，不算皮卡丘的情況下，原動畫中小智收服的9只寶可夢，有6只是沒有完全進化的，
唯一能拿得上台面的就只有流氓鱷了，結果打虎徹的時候還沒上。
小智合眾隊總體強度︰
厲害︰藤藤蛇，流氓鱷，炒炒豬，藍蟾蜍，
中等︰保姆蟲，
弱︰高傲雉雞，水水獺，滑滑小子，地幔岩，
這是單純從該寶可夢的戰績來看的，跟這種寶可夢的強度無關。
第三，同伴。
說實話，超級願望的小智的旅行同伴，我是很不習慣的。
原本的小剛多好，我不知道為什麼想當醫生就不能繼續旅行了，在旅行途中不是可以學到更多東西嗎？
制作組想讓小剛下線就直說。
因為剛爺在團隊中，負責了非常多事情，做飯，治療寶可夢，觀戰時為觀眾科普各種技能和特性的效果，等等。
雖然見到大姐姐就不正經了，但也比天桐的那個又臭又長的什麼破酒侍鑒定時間好得多。
然後是女主，你看看其他的動畫女主，小遙，小光，莎莉娜，莉莉艾等等，都是人氣極高的萌萌噠，
到了超級願望這里，直接給我整了個黑妹出來，丑就算了，
還天天以一副高高在上的姿態，罵小智是小孩子，從早罵到晚，從第一集罵到最後一集，
搞得好像她多牛逼一樣，你艾莉絲要是真這麼厲害，那龍頭地鼠還能不听你話？那你一開始的時候手上的龍系寶可夢還能只有一只戰斗力幾乎為0的牙牙？
雖然你艾莉絲應該不是新人，但人家小智好歹也是旅行過四個地區啊，天天罵小智，我是真受不了。
如果你編劇真的沒人可寫了，那游戲里面的女主，斗子和鳴依呢，這麼萌萌噠，人氣又超高，你咋不寫進動畫里呢。
第四，勁敵。
超級願望里面，我唯二承認的兩個小智的勁敵，就是肯尼•永遠念不對名字•洋和虎徹。
肯尼洋不用多說，經常被人叫錯名字不說，他是合眾人當中為數不多的不會盛氣凌人，沒什麼缺點的人，相信大家也都能感覺出來。
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