這件事情，還得從幾個月前的八月說起。
1944年8月，東京作戰總指揮部發出了一條指令給負責南洋戰俘管理的指揮官,勾勒出一個被稱為“囚犯的最後安置”的政策。
這份文件的一份副本就是世人皆知的“八月一日完全屠殺命令”,後來在東京被作為懲治戰犯的罪證。
指令要求菲律賓、馬來西亞的日軍，必須依據這份指令，在自己所轄地區，清除所俘虜的盟軍戰俘。所謂清除，實際就是有計劃的屠殺，可以是槍殺，也可以是炸彈、毒煙、毒劑、溺水或斬首等任何種手段。
對于大本營的這個命令，接到命令的南方軍內部也不是特別明白原因何在，但上級既然下達了，那他們就得執行。于是菲律賓的山下奉文和馬來半島的土肥原賢二這兩位駐地最高指揮官就成為最後的命令傳達者和執行者。
要說二戰日軍所俘獲的盟軍戰俘，也只有菲律賓投降的美軍美軍+菲律賓軍）和馬來半島投降的英國軍隊英國人+印度人+澳大利亞）了。
在菲律賓投降日軍的，美菲聯軍部隊多達七萬六千余人；在馬來半島投降日軍的英聯邦士兵更多嗎，差不多有十四萬人，其中光是英國士兵就有九萬多人。
投降後的盟軍士兵，在戰俘營的日軍當然可以隨意處置，美軍戰俘在菲律賓的“死亡行軍”，盟軍士兵在泰國的“死亡鐵路”等都是他們真實的寫照。雖然悲慘，仍然有人堅持下來活下來了。可這一次不同，日本人要將全部戰俘全部處理掉了，而命令來自國內最高層。
接到了命令，山下奉文和土肥原賢二當然得執行。好在山下奉文那邊的美軍戰俘絕大多數早就運送到泰國，修築泰國到緬甸的死亡鐵路去了，要殺也沒有幾個了，但土肥原賢二就不同了，關押在馬來半島的英聯邦士兵戰俘，可是還有不少。
投降的英聯邦戰俘，有相當部分也被送去了泰國修建鐵路，但十四萬人的戰俘，仍然有三分之一數量留在馬來半島，給日軍做苦力。這三分之一的數量，也接近五萬人，里面以英國和澳大利亞白人士兵居多。
土肥原賢二知道自己踫到了一個燙手山芋，熟知中國歷史，知道自己已經是“年過花甲”的他，已經遇見到了日本戰敗的可能。現在手里要是再沾上盟軍戰俘的血，戰後他肯定會被同盟國一方特別關照的。
其實土肥原心里也清楚，當失敗的可能性增大時，大河民族所有人就會墮入瘋狂，他們會傾向采取野蠻的流血行為，不管是對敵人還是自己。這一次高層的命令，正是這一瘋狂現象的體現。
內心已經有了懼意的土肥原，不想親自下達這個命令，就找來了自己的參謀長綾部橘樹中將，讓他去給下屬傳達這個命令。沒有想到這位參謀長也是一個老奸巨猾的家伙，竟然要土肥原在命令上簽字。不想在部下面前露怯的土肥原只能咬牙簽下自己的名字，綾部橘樹中將這才去下達命令。
事後被第七方面軍屠殺的英聯邦戰俘數量有多少，土肥原賢二自己也不知道，因為執行的時間也長達一個多月，且一沒有統計清點，二沒有詳細報告。直到英印第十四集團軍在北部進行試探性進攻，還沒有被處理完的戰俘，才被調去修築半島的防御工事，這件事才算是告一段落。
菲律賓萊特島失陷，山下奉文對外發出馬尼拉不設防的通告，將部隊和自己的司令部撤出了馬尼拉，表面看起來似乎很人道，是在為馬尼拉城里的菲律賓人考慮，其實卻是迫不得已。
首先，沒有海軍的配合，又失去了制空權，讓日軍守在馬尼拉城里看起來不錯，其實就是在美軍海空優勢下送死。特別是美國人的空中飛機，隨便扔下幾顆炸彈，就能將守城的日軍士兵埋在廢墟里。
其次，通過放棄馬尼拉，日軍可以集中力量在其他地區，利用山地和森林進行防御和戰斗，減少不必要的犧牲，保存己方有生力量。
最後一個，就是虛假宣傳了，讓國際上看到日軍也是愛民的，也是會照顧菲律賓城市不遭受火炮毀壞而主動退出的。
不過山下奉文的這種做法，給了臨近馬來半島的土肥原賢二造成了一個誤會，以為前者是在給自己留後路，主動向盟軍示好，加上南方軍司令部又從馬尼拉搬走，馬來半島又遭遇緬印盟軍的猛攻，一個旅團已經完蛋，讓他內心慌的一批，這才做出新加坡也不設防的愚蠢行為，結果就招來了寺內壽一的臭罵。
挨了罵的土肥原賢二，根本就不敢分辯，連忙又讓參謀長對外通告第七方面軍將堅守馬來半島，這才讓寺內壽一停歇了怒火。
寺內壽一是不罵了，可土肥原賢二內心真的是沒有底。第七方面軍雖然是一個方面軍，下屬有第十六、二十五、二十九、三十七等四個軍，看起來實力雄厚，可所有部隊加起來也不過四個師團帝汶島的第四十八師團歸第二軍管轄）又八個獨立混成旅團，以及十一個獨立守備步兵大隊的部隊。
四個軍，平均下來一個軍只有一個師團、兩個獨立混成旅團和三個獨立守備大隊的兵力，卻要防御管轄整個南洋除菲律賓之外的所有地區的島嶼，且很多島嶼上的日軍部隊受損嚴重，損失人員都沒有得到補充，兵力根本沒有滿編。
拿駐守甦門答臘島的第二十五軍來說，只有兩個獨立混成旅團25、26）的兵力，且都還龜縮在島的南部，守在石油產地巨港周圍，島北部已經全部被棉蘭抗日軍佔領，抗日軍人數也擴大到了三萬余人，且將實力漸漸向島的中部廖內擴展。二十五軍司令官田邊盛武對此束手無策，毫無應對辦法，手中兵力嚴重不足的他只能守住石油重地，其他地方只能是望“地”興嘆了。